持有D證可以駕駛排量超過250cc的摩托車。根據(jù)《中華人民共和國道路交通安全法》及駕駛證準駕規(guī)則，D證作為最高級別的摩托車駕駛證，其準駕范圍覆蓋了發(fā)動機排量大于50ml或最大設(shè)計車速超過50km/h的三輪摩托車，同時還可兼容E證準許駕駛的車型——即排量大于50ml的二輪摩托車。而排量超過250cc的摩托車顯然屬于“發(fā)動機排量大于50ml”的范疇，只要車輛行駛證明確標注為摩托車，且不用于運輸經(jīng)營等商業(yè)用途，持有D證即可合法駕駛這類大排量車型。

從準駕規(guī)則的細節(jié)來看，D證的覆蓋范圍既包括三輪摩托車，也涵蓋二輪摩托車，且對排量的限制僅以“大于50ml”為界線，并未設(shè)置250cc的上限。以三輪摩托車為例，即便是排量達到500cc的非商業(yè)用途車型，只要行駛證登記為普通三輪摩托車，持有D證的駕駛員就能合法駕駛；而對于二輪摩托車，無論是250cc以上的中大排量車型，還是日常常見的小排量車型，只要符合“排量大于50ml且設(shè)計車速超過50km/h”的標準，D證同樣適用。這種設(shè)計充分考慮了摩托車使用場景的多樣性，為駕駛員提供了更靈活的駕駛權(quán)限。

需要特別注意的是，D證的合法駕駛范圍僅限于“非商業(yè)用途”的摩托車。如果駕駛員將車輛用于運輸經(jīng)營、快遞配送等商業(yè)活動，就需要額外考取D1證或D2證等專門的營運類駕駛證，這是為了確保商業(yè)運輸場景下的安全規(guī)范，與普通非營運用途的駕駛資格進行區(qū)分。因此，判斷能否駕駛的核心依據(jù)始終是車輛的行駛證信息：只要證件上明確標注為“摩托車”，且使用性質(zhì)為非營運，D證持有者就無需擔心排量超過250cc的問題。

從法規(guī)邏輯來看，D證作為摩托車駕駛證的最高級別，其設(shè)計初衷就是覆蓋所有常規(guī)摩托車類型。無論是早期的小排量代步車，還是如今越來越普及的中大排量休閑摩托車，只要屬于“摩托車”這一車型類別，且符合非營運的使用性質(zhì)，D證的準駕資格就完全適用。這一規(guī)則既體現(xiàn)了法規(guī)的嚴謹性，也為摩托車愛好者提供了清晰的駕駛權(quán)限指引，避免因排量問題產(chǎn)生不必要的誤解。

綜上所述，持有D證駕駛排量超過250cc的摩托車是完全合法的，前提是車輛屬于非商業(yè)用途且行駛證登記為摩托車。D證的準駕規(guī)則以“排量大于50ml”為核心標準，并未對250cc以上的大排量車型設(shè)限，同時通過區(qū)分營運與非營運用途，確保了不同使用場景下的駕駛規(guī)范。駕駛員只需關(guān)注車輛行駛證的標注信息，即可明確自身的駕駛權(quán)限，無需因排量數(shù)值產(chǎn)生顧慮。